Bitbucketどうもいつも新しいレポジトリを作った時にIssue管理(課題管理)を有効にしないといけないみたいですね.

レポジトリ作るときは、以下で有効にする.

レポジトリ作成時

詳細設定を開かないと出てこないので、やや見つけにくい

設定変更時

いつでも追加できるので、任意のタイミングで設定する場合は、
レポジトリの設定から変更する.

以下の設定を押して

そしたら、「課題管理」で「トラッカーなし」以外を選べばIssueが使えるようになります.